پپتیدهای نافذ به سلول چیست؟

پپتیدهای نافذ سلولی پپتیدهای کوچکی هستند که به راحتی می توانند به غشای سلولی نفوذ کنند.این دسته از مولکول‌ها، به‌ویژه CPP‌ها با عملکردهای هدف‌گیری، نویدبخش تحویل دارو به سلول‌های هدف هستند.

بنابراین، تحقیق در مورد آن از اهمیت زیست پزشکی خاصی برخوردار است.در این مطالعه، CPP‌های با فعالیت‌های گذرنده متفاوت در سطح توالی مورد مطالعه قرار گرفتند و سعی شد عوامل مؤثر بر فعالیت گذر غشایی CPPها، تفاوت‌های توالی بین CPP‌های با فعالیت‌های مختلف و غیرCPP‌ها مشخص شود و روشی برای آنالیز توالی‌های بیولوژیکی معرفی شود.

توالی‌های CPP و NonCPP از پایگاه‌داده CPPsite و متون مختلف به‌دست آمدند، و پپتیدهای گذرنده (HCPPs، MCPPs، LCPPs) با فعالیت گذرنده بالا، متوسط ​​و پایین از توالی‌های CPPs برای ساخت مجموعه‌های داده استخراج شدند.بر اساس این مجموعه داده ها، مطالعات زیر انجام شد:

1، ترکیب اسید آمینه و ساختار ثانویه CPP های مختلف فعال و غیر CPP با استفاده از ANOVA تجزیه و تحلیل شد.مشخص شد که برهمکنش های الکترواستاتیک و آبگریز اسیدهای آمینه نقش مهمی در فعالیت گذر غشایی CPP ها ایفا می کند و ساختار مارپیچی و سیم پیچی تصادفی نیز بر فعالیت گذر غشایی CPP ها تأثیر می گذارد.

2. خواص فیزیکی و شیمیایی و طول CPP ها با فعالیت های مختلف بر روی صفحه دو بعدی نمایش داده شد.مشخص شد که CPP ها و NonCPP ها با فعالیت های مختلف می توانند تحت برخی ویژگی های خاص دسته بندی شوند و HCPP ها، MCPP ها، LCPP ها و NonCPP ها به سه خوشه تقسیم شدند که تفاوت های آنها را نشان می دهد.

3. در این مقاله مفهوم مرکز فیزیکی و شیمیایی توالی بیولوژیکی معرفی شده و بقایای تشکیل دهنده توالی به عنوان نقاط ذره ای در نظر گرفته شده و دنباله به عنوان یک سیستم ذره ای برای تحقیق انتزاع شده است.این روش برای تجزیه و تحلیل CPP ها با طرح CPP ها با فعالیت های مختلف بر روی صفحه سه بعدی به روش PCA اعمال شد و مشخص شد که اکثر CPP ها با هم و برخی از LCPP ها در کنار هم با NonCPP ها خوشه می شوند.

این مطالعه پیامدهایی برای طراحی CPP ها و درک تفاوت در توالی CPP ها با فعالیت های مختلف دارد.علاوه بر این، روش تجزیه و تحلیل مرکز فیزیکی و شیمیایی توالی های بیولوژیکی معرفی شده در این مقاله می تواند برای تجزیه و تحلیل سایر مسائل بیولوژیکی نیز مورد استفاده قرار گیرد.در عین حال، آنها می توانند به عنوان پارامترهای ورودی برای برخی از مسائل طبقه بندی بیولوژیکی مورد استفاده قرار گیرند و در تشخیص الگو نقش داشته باشند.